RNA, RNP
Responsables : Bruno CHARPENTIER et Xavier MANIVAL
Bienvenue sur la page dédiée à notre équipe de recherche en biologie moléculaire et ARN. Notre activité scientifique se focalise sur les mécanismes moléculaires fondamentaux qui sous-tendent la biologie cellulaire, avec un accent particulier sur les composants ARN. Forte de plusieurs décennies d’expérience, notre équipe est reconnue pour ses contributions significatives dans des domaines tels que la maturation des ARN, la modification post-transcriptionnelle des ARN, et la biogenèse des complexes ARN-protéines, également connus sous le nom de Ribonucléoprotéines (RNP).
Originalité de nos Travaux : Approche Multidisciplinaire et Implications Cliniques
L’originalité de nos travaux réside dans notre approche multidisciplinaire. Nous utilisons une panoplie de techniques allant du criblage génétique et des analyses de liaison génétique à la transcriptomique, protéomique, génétique moléculaire, biologie cellulaire et moléculaire, biochimie, jusqu’aux études structurales à l’échelle atomique. Récemment, nous avons élargi nos activités à des études cliniques, collaborant avec des projets locaux en santé tels que RHU FIGHT-HF et LUE IMPACT Geenage. Nous avons également investi dans la valorisation de nos données de recherche fondamentale, conduisant à des projets de pré-maturation en collaboration avec la SATT SAYENS, certains aboutissant ou étant en voie de brevetage ([]).
Affiliations et Réseaux Scientifiques
Notre équipe fait partie du groupe thématique sifrARN (Structure, Intégration, Fonction et Réactivité de l’ARN) de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire (SFBBM) et est membre du GDR RNA (Groupement De Recherche 2083) « RNA as a tool and a target for medicinal chemistry and chemical biology ». Nous faisons également partie intégrante du réseau ProteinLorraine, rassemblant une douzaine de laboratoires affiliés à six pôles scientifiques de l’Université de Lorraine.
Thématiques de Recherches Actuelles
Actuellement, les thèmes de recherche de notre équipe s’articulent autour de la biogenèse des Ribonucléoprotéines (RNP) et de leur implication dans des conditions normales, en adaptation à des situations de stress, ainsi que dans le cadre de pathologies, en particulier en lien avec des programmes locaux en recherche clinique et translationnelle (IHU, FHU, LUE iSITE).
Projets de Recherche Clés
Projets centrés sur la biologie de l’ARN non codant et l’assemblage des complexes ribonucléoprotéique dans des contextes physiologiques et pathologiques (stress cellulaire, cancer, maladies cardiovasculaires ou rares).
Cette illustration présente différentes familles de complexes RNP formés avec les ARN non codants (ARNnc) et leurs rôles dans la cellule.
UsnRNP : impliqués dans l’épissage des ARN pré-messagers.
snoRNP/scaRNP : responsables de modifications post-transcriptionnelles des ARN cibles.
miRNP : régulent la traduction des ARN messagers.
SRP : dirige la translocation des protéines vers le réticulum endoplasmique.
lncRNP ANRIL : module l’expression des gènes.
Assemblage de macrocomplexes ARN-protéine
- Assemblage des snoRNP C/D : Exploration approfondie de la voie d’assemblage des snoRNP C/D avec un accent sur la caractérisation des composants de la machinerie d’assemblage, y compris le complexe protéique co-chaperon R2TP. (hal-00280860; hal-01455098 ; hal-01452718 ; hal-01453204 ; hal-02279890 ; hal-01636562 ; hal-02343521 ; hal-01451914 ; hal-02087019 ; hal-03070334 ; hal-03583324 ; hal-04020084 ; hal-03843986 ; hal-03181046).
- Assemblage de la particule SRP : Élucidation du mécanisme de biogenèse de la particule SRP essentielle à l’adressage des protéines membranaires. (hal-01064047)
Identification de la fonction des snoRNA orphelins
Étude des Snord116 : Caractérisation approfondie des snoRNA orphelins de la famille Snord116, avec un accent sur leur rôle dans le Syndrome de Prader Willi et développement de thérapies potentielles. (hal-03481280).
Connexions entre machineries d’assemblage
- Connexion snoRNP/miRNP : Investigation des liens entre la biogenèse des snoRNP et miRNP, en particulier la formation de complexes RPAP3/TRBP. (hal-03583324).
- Ribosomes et SRP : Exploration de la coordination entre les biogenèses des ribosomes et SRP pour comprendre les connexions entre ces deux nanomachines cellulaires essentielles.
Biogenèse de RNP et condensats nucléaires
- Nucléole : Étude de l’impact de l’état fonctionnel des nucléoles sur la biogenèse de la SRP et vice versa.
- Corps de Cajal (CB) : Caractérisation des effets du stress oxydant sur la composition et la fonction des CB.
Action de miRNA dans un contexte hétérologue
Interaction des miRNA fécaux avec le microbiote : Collaboration avec des équipes externes pour étudier le mode d’action des miRNA fécaux dans un contexte biologique hétérologue, en particulier leur impact sur la composition du microbiote.
Dissection fonctionnelle du lncRNA ANRIL
Modulation des marques d’histones, topologie nucléaire, et épissage alternatif : Caractérisation fonctionnelle d’ANRIL et développement de molécules thérapeutiques potentielles. (hal-01715217 ; hal-03202552).
Étude fonctionnelle du lncRNA LEF1-AS1
Associations à l’insuffisance cardiaque, vieillissement et métabolisme du cholestérol : Caractérisation des mécanismes moléculaires liant LEF1-AS1 à ces phénomènes et identification des domaines impliqués
Adaptation du transcriptome en réponse à des stress
Régulation de l’épissage alternatif (EA) : Étude des mécanismes de régulation de l’EA en réponse à un stress thermique ou oxydant, avec un focus sur la modulation de l’EA des transcrits du gène de la gamma glutamyl-transférase (GGT-1)
Notre équipe poursuit des recherches de pointe dans ces domaines, contribuant ainsi à l’avancement des connaissances scientifiques fondamentales et ouvrant de nouvelles perspectives pour des applications cliniques. Pour toute collaboration, question ou information supplémentaire, n’hésitez pas à nous contacter.
Membres de l’équipe
Principales publications
Financements
